主要为剂量依赖性的骨髓抑制,如中性粒细胞减少、贫血等。
其他副作用有恶心、呕吐、腹泻、厌食、药疹、咳嗽、肺炎等。严重的还可引起失明、死亡等。
磷酸氟达拉滨治疗的患者中出现严重的机会性感染,已经有引起死亡的严重不良事件的报道。